| 鸡Z染色体基因表达的密码子偏性 |
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| 引用本文： | 饶友生,梁菲菲,王樟凤,柴学文,张细权.鸡Z染色体基因表达的密码子偏性[J].航空工程进展,2010(1). |
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| 作者姓名： | 饶友生 梁菲菲 王樟凤 柴学文 张细权 |
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| 作者单位： | 饶友生,王樟凤,柴学文,RAO You-sheng,WANG Zhang-feng,CHAI Xue-wen(江西教育学院,生物技术研究所,江西,南昌,330029);梁菲菲,张细权,LIANG Fei-fei,ZHANG Xi-quan(华南农业大学,动物科学学院,广东,广州,510642)? |
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| 基金项目： | 江西省教育厅科研项目,国家高技术研究发展计划(863计划)? |
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| 摘 要： | 从NCBI 数据库(http:∥www.ncbi.nlm.nih.gov/projects/mapview/map)下载鸡Z染色体上全部基因完整的cDNA,最终共有626个基因的CDS序列纳入统计分析.使用CodonW(1.4.2)进行密码子偏性分析,确定了CGG、AGC、UGC等26个密码子为Z染色体基因表达的"最优"密码子.对应分析表明,影响鸡Z染色体基因表达的密码子偏性的主要因素分别为GC3s、基因的表达丰度、GC含量、CDS长度及氨基酸的疏水性.鸡Z染色体基因表达的密码子用法受到了核苷酸组成偏好的显著影响,这种核苷酸组成偏好很可能是突变偏畸、固定偏畸及基因转换导致的.对于鸡这种群体有效规模较大的群体,密码子的偏性更有可能是核苷酸组成偏好及选择等因素综合作用的结果.
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| 关 键 词： | 鸡 Z染色体 密码子 偏性 |
Study on the Codon Bias of Genes Expression in GGAZ |
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| RAO You-sheng,LIANG Fei-fei,WANG Zhang-feng,CHAI Xue-wen,ZHANG Xi-quan.Study on the Codon Bias of Genes Expression in GGAZ[J].Advances in Aeronautical Science and Engineering,2010(1). |
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| Authors: | RAO You-sheng LIANG Fei-fei WANG Zhang-feng CHAI Xue-wen ZHANG Xi-quan |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | chicken GGAZ codon bias |
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